CodonCode Aligner – DNA sequence Assembly and Alignment on Windows a Mac OS X

CodonCode Aligner je program pro sestavení sekvence, contig editace, a detekce mutace, k dispozici pro Windows a Mac OS X. Aligner je kompatibilní s Phred-Phrap a plně podporuje skóre kvality sekvence, a zároveň nabízí známé, snadno naučit uživatelské rozhraní, jak je znázorněno na následujících snímků obrazovky:

Contig přehled zarovnání se stromem  rozdíl tabulka  trasování Zobrazení a omezení mapa

stáhnout CodonCode Aligner

CodonCode Aligner ceny a informace o objednávce

koupit

s Codoncode Aligner, můžete:

  • importovat sekvence z textových souborů
  • importovat sekvence ze souborů ABI, SCF a FASTQ
  • koncový klip
  • Vector trim
  • sestavit contigs
  • Zarovnat na referenční sekvenci
  • zarovnejte kontigy k sobě při zachování odkazů na stopy
  • sestavit nebo zarovnat do skupin, na základě vzorku jména
  • Najděte heterozygotní mutace
  • analyzujte heterozygotní Vložení a odstranění
  • Definujte oblasti zájmu („funkce“), například regiony s nízkou kvalitou konsensu
  • Rychlá navigace mezi uživatelem definovanými funkcemi
  • generovat fylogenetické stromy a restrikční mapy
  • spusťte Phred a Phrap přímo z projektů Aligneru
  • Export sekvencí a funkcí
  • viz rozdílové tabulky a překlady bílkovin
  • designové primery
  • Sestavte bakteriální genomy a malé sekvenční projekty NGS
  • najít enzymy pro analýzu RFLP & vytvořit virtuální gel
  • analyzovat methylované sekvence & Zobrazit nezpracovaná data trasování

CodonCode Aligner vám umožní plně využít moderní algoritmy pro základní volání a sestavení sekvencí, aniž byste se museli učit složité možnosti příkazového řádku nebo programování Perl.

máte zájem? Pokračujte a stáhněte si demo verzi Codoncode Aligner. Demo verze je plně funkční sledování prohlížeč a editor. První uživatelé získají automatickou 30denní zkušební verzi, která vám umožní vyzkoušet všechny funkce v Codoncode Aligner.

Po stažení doporučujeme sledovat úvodní video, abyste se seznámili s nejdůležitějšími funkcemi Aligneru.

občas zpřístupňujeme registrovaným fanouškům CodonCode Aligner na Facebook zvýhodněné Licence – podrobnosti najdete na CodonCode Aligner na Facebook!

Codoncode Aligner na Facebook

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.