co je extrachromozomální kruhová DNA a co dělá?

je známo, že DNA v buněčném jádru je balena ve formě lineárních chromozomů. Po mnoho let vědci pozorovali menší délky DNA vedle chromozomů, které jsou organizovány v kruhových formách. Některé z těchto částic, které byly označovány jako extrachromozomální kruhová DNA (eccdna) nebo mikrodna, jsou obvykle malé (<1 kb), genově řídké a nezamplifikované. Celková hojnost eccDNA v buňkách může být až několik set na buňku. molekuly eccDNA jsou také přítomny v oběhu v bezbuněčné formě a nabízejí možnost sloužit jako biomarkery na bázi krve. U nádorů lze detekovat jiný typ extrachromozomální kruhové DNA, která se zdá být exkluzivní pro rakovinné buňky. Dříve označované jako dvojité minuty, ale nyní označované jako extrachromozomální DNA (ecDNA), protože obvykle nejsou dublety, jsou tyto částice ecDNA často velmi velké (střední velikost 1.3 Mb), vysoce amplifikovaný s mnoha kopiemi na buňku a obsahuje mnoho genů a regulačních oblastí, s výrazným obohacením onkogenů. Důležité je, že v rakovinných buňkách se ekdna zdají být transkripčně aktivnější než jejich chromozomální protějšky a bylo podezření, že poskytují rakovinným buňkám výhodu růstu a přežití. V současné době není vztah mezi eccDNA v normálních buňkách a ecDNA v rakovině, pokud existuje, pochopen. Být takovou záhadnou formou genetického materiálu, položili jsme otázky o eccdna a ecdna panelu odborníků v oboru, kteří studovali aspekty eccdna a ecdna, od jejich biofyzikálních vlastností, výrobní mechanismy, fyziologické role, role v biologii rakoviny, a diagnostický potenciál.

co dělají eccdna? Co vás na eccDNA zatím nejvíc překvapilo?

Anton Hensson: ecDNA je vehikulem pro protoonkogenové amplifikace u rakoviny. To je již nějakou dobu známo. Co bylo překvapivé, je frekvence ecDNA u rakoviny a schopnost ecDNA tvořit velmi složité struktury, včetně částí z různých chromozomů, stejně jako jejich schopnost re-vložit do genomu.

Paul Mischel: zaměřím své komentáře na svou oblast výzkumu, ecDNA v rakovině. Největším překvapením pro mě je, jakou klíčovou roli hraje ecDNA v rakovině člověka. Naše data naznačují, že ecDNA hraje klíčovou roli při řízení agresivního chování některých z nejvíce maligních forem rakoviny prostřednictvím alespoň tří prokládacích mechanismů: Nechromozomální) dědičnost, která umožňuje nádorům dosáhnout velmi vysokého počtu kopií onkogenu při zachování intratumorální genetické heterogenity; 2) intratumorální genetická heterogenita generovaná tímto mechanismem dědičnosti umožňuje nádorům rychle se vyvíjet v reakci na měnící se podmínky, včetně léčby, což představuje pozoruhodnou schopnost některých rakovin měnit své genomy rychlostí, kterou nelze vysvětlit chromozomální dědičností.; 3) vysoká úroveň šablony DNA dosažená nemendelovskou dědičností a výběrem ve spojení se změněnou organizací chromatinu generovanou kruhovou architekturou, kterou jsme demonstrovali (identifikováni v práci úzce provedené s Dr. Howardem Changem), vede k masivní transkripci onkogenů. Dohromady tyto vlastnosti začínají vysvětlovat, proč se zdá, že některé rakoviny genomicky explodují a mění se, proč nepodléhají čistým selektivním zametáním a proč se zdá, že každá buňka v nádoru je schopna rekapitulovat celý nádor s plným spektrem heterogenity u některých typů rakoviny. Poskytuje také určitý pohled na to, proč cílené terapie proti onkogenům amplifikovaným na ecDNA nebyly tak úspěšné, jak se očekávalo.

Anindya Dutta: je známo, že dlouhé eccdna viditelné u rakovin karyotypizací, nazývané také dvojité minuty nebo ecdna, nesou onkogeny, které jsou amplifikovány na podporu rakoviny. Nedávné výsledky naznačují, že existuje velká populace menších eccdna, <1000 bp dlouhých, které tvoří 90% eccDNA v normálních buňkách a rakovinných buněčných liniích. Rakovinné buňky také obsahují delší ekdna, ne vždy viditelné karyotypizací, které se pohybují ve velikosti od 1 kb do dvojnásobné minuty. Kruhy, které jsou dostatečně dlouhé, aby obsahovaly plné geny, mohou geny nadměrně exprimovat a zesílit je. To je velmi důležité pro rakoviny obsahující dlouhé ecdna. Funkce malých kruhů je nejasná, ale ukázali jsme, že mohou deregulovaným způsobem exprimovat RNA a že RNA jsou zpracovávány na mikroRNA a malé interferující RNA, aby potlačily buněčné geny.

pro mě zůstává největším překvapením náš původní objev, jak všudypřítomné jsou eccdna, a to i v normálních tkáních a skutečnost, že většina z nich je somaticky mozaiková (odlišná mezi různými buňkami) i u rakovin. Pouze tehdy, když poskytují selektivní výhodu buňkám, jako to dělají eccdna nesoucí onkogeny u rakovin, je stejná eccDNA pozorována v mnoha buňkách rakoviny.

Birgitte Regenberg: zjistit, že: 1) eccDNA je běžný genetický prvek v eukaryotických buňkách, 2) eccDNA může vzniknout ze všech částí eukaryotických genomů, 3) Výběr může vést ke společné amplifikaci zesilovačů a onkogenů na komplexní eccDNA v nádorech, 4) zdá se, že určitá lokusy vytvářejí eccDNA opakovaně a vysokou rychlostí v kvasinkách (CUP1 a HXT6 HXT7). Druhý výsledek je opravdu zajímavý, protože naznačuje, že eccDNA může hrát důležitou roli v evoluci tím, že poskytuje rychlou adaptaci na změny v prostředí (vysoká cupper, CUP1 a nízká glukóza, HXT6 HXT7).

Dennis Lo: Moje skupina se poprvé začala zajímat o eccDNA, když jsme začali hledat kruhové molekuly DNA v lidské plazmě. Naše cesta začala zkoumáním mitochondriální DNA (mtDNA), která existuje uvnitř mitochondrionu jako kruhový kus molekuly DNA přibližně 16 kb. Naše výsledky ukázaly, že obě kruhové a lineární mtDNA molekuly existují v lidské plazmě. Jedním překvapením z této práce je naše demonstrace, že kruhové molekuly mtDNA a lineární molekuly mtDNA mají různé tkáně původu. Proto jsou kruhové molekuly mtDNA převážně z hematopoetického systému, zatímco lineární molekuly mtDNA jsou převážně z jater.

od té doby jsme rozšířili naši práci o hledání eccDNA v plazmě. Zejména jsme prokázali, že fetální molekuly eccDNA jsou detekovatelné v plazmě těhotných žen. Naše skupina se již mnoho let zajímá o distribuci velikosti cirkulující DNA. Je zajímavé poznamenat, že molekuly eccDNA v mateřské plazmě (s výraznými velikostními vrcholy při 202 bp a 338 bp) mají delší distribuci velikosti než lineární molekuly DNA (modální velikost při 166 bp). Naše předchozí práce na lineárních molekulách DNA v plazmě ukázala, že lineární molekuly DNA plodu v mateřské plazmě mají o něco kratší distribuci velikosti než lineární molekuly DNA mateřského původu. Dalším překvapením naší práce je, že jsme pozorovali podobnou krátkost cirkulujících molekul eccDNA plodu ve srovnání s molekulami mateřského původu.

jaká je vaše preferovaná hypotéza ohledně produkčního mechanismu eccdna v buňkách? Jaké důkazy existují na podporu této hypotézy?

Anindya Dutta: myslím, že eccdna jsou produkovány jako vedlejší produkt opravy DNA. Hlavním důkazem toho je, že jsou zvýšeny látkami, které zvyšují poškození DNA, a hlásili jsme, že určité geny pro opravu DNA, jako je MSH3 (zapojené do opravy nesouladu), jsou nutné k produkci eccdna.

Birgitte Regenberg: Upřednostňuji model, ve kterém může jakákoli forma poškození DNA potenciálně vést k cirkularizaci DNA prostřednictvím známých mechanismů opravy DNA. To zahrnuje jejich tvorbu homologní rekombinací, mikrohomologií a nehomologickým spojením s jinými cestami opravy DNA. Většina našich důkazů je založena na homologii kolem chromozomálního bodu zlomu, který vedl k eccDNA, a myslím, že mutantní studie jsou stále nutné ke stanovení kauzality. Re-replikace může také produkovat kruhovou DNA, jak je vysvětleno v modelu zesílení obráceného opakování závislého na původu (od Maitreya Dunham), ale stále musíme prozkoumat, jak důležitý je tento mechanismus. Kromě náhodných procesů vzniká několik kruhů řízenou rekombinací (excizní kruhy receptoru T-buněk) a retro-transpozicí, když dlouhá terminální opakování eccDNA vzniká cirkularizací extrachromozomální lineární DNA během transpozičního životního cyklu retrotranspozonů.

Anton Henssen: Na základě publikované literatury a našich vlastních pozorování se domnívám, že by mohlo existovat mnoho různých mechanismů přispívajících k vytváření eccDNA. EccDNA může být vytvořena katastrofickými procesy přeskupení genomu, jako je chromotripse, ale existují i další procesy genomické nestability, které mohou přispět k jejich tvorbě.

Paul Mischel: opět se zaměřím své odpovědi na ecDNA u rakoviny. Existuje historický pohled na tvorbu ecDNA, nebo v té době nazývané dvojitá minutová formace, ve kterém se stane něco, co má za následek odstranění úseku DNA z jeho nativního chromozomálního umístění, následovaná replikací a amplifikací jako ecDNA. Vědci, včetně Roberta Schimkeho, Geoffa Wahla, Nicholase Vogta a Bernarda Malfoye, mimo jiné přispěli k těmto znalostem. Přesné molekulární mechanismy, jejich vztah k možným abnormalitám v systému poškození DNA a reakce, zůstávají neúplně pochopeny. Je to oblast aktivního výzkumu, a to i v naší laboratoři. Kromě toho David Pellman a další navrhli, že chromothripsis, ke kterému dochází, když se zaostávající chromozom „zasekne“, “ umístěn do mikrojader, a účinně nasekaný, by mohl potenciálně tvořit ecDNA. Nedávná experimentální práce Petera Ly a Dona Clevelanda, ve kterém vytvořili chromotriptický chromozom Y, naznačuje, že chromotripse může vést k tvorbě ecDNA jako mechanismu amplifikace genů. Proto je docela možné, že více mechanismů by mohlo vést k tvorbě ecDNA, která se pak chová výběrem. Bude důležité vyvinout hlubší mechanistické porozumění procesům, které přispívají k tvorbě ecDNA.

Dennis Lo: v naší analýze distribuce velikosti zahrnující molekuly eccDNA v mateřské plazmě jsme pozorovali řadu výmluvných důkazů nukleosomálních podpisů. Například jsme pozorovali periodicitu 10 bp v distribuci velikosti V blízkosti prominentních velikostních vrcholů 202 bp a 338 bp. Naše domněnka je, že Velikost 202 bp je přibližně velikost nukleosomového jádra plus dva linkery, zatímco velikost 338 bp je přibližně velikost dvou nukleosomových jader plus dva linkery. Dalším pozoruhodným pozorováním je, že mezi nejčastěji pozorovanými molekulami eccDNA v mateřské plazmě, Pozorovali jsme čtyři sady trinukleotidových motivů na junkčním místě molekuly eccDNA. Na takovém místě jsou první a třetí motivy přímými opakováními, zatímco druhý a čtvrtý jsou další sadou přímých opakování. Doufáme, že tato pozorování přispějí k lepšímu porozumění mechanismu výroby eccDNA. Plně chápeme, že nemáme všechny informace, abychom vytvořili úplný model, ale věříme, že pole jako celek k tomu postupuje.

co je známo o eccdna a rakovině? Jakým způsobem přispívají eccdna k maligním vlastnostem rakovinných buněk?

Paul Mischel: naučili jsme se následující: 1) ecdna se zdají být výlučné pro rakovinu, nebo alespoň to ještě musíme vidět v normálních buňkách, 2) ecdna řídí vysoký počet kopií onkogenu a udržují intratumorální genetickou heterogenitu prostřednictvím svého mechanismu Nemendelovské, nechromozomální dědičnosti; 3) ecdna, kvůli tomuto mechanismu dědičnosti, mohou rychle změnit své genomy, včetně vyhýbání se terapiím; 4) Vysoká úroveň šablony dna ecDNA, spojená se změněnou architekturou chromatinu, řídí masivní transkripci onkogenu a může remodelovat epigenom způsoby, které přispívají k tumorigenezi.

Anton Henssen: ecDNA není jen prostředkem pro amplifikaci onkogenu, ale může také přispět k remodelaci genomu prostřednictvím jeho opětovné integrace do lineárního genomu. Ukázali jsme, že reintegrace kruhové DNA vede k narušení funkčně důležitých genomických oblastí a že toto narušení by mohlo přispět k mnoha maligním rysům rakovinných buněk.

Birgitte Regenberg: víme, že amplifikace řady onkogenů na eccDNA koreluje s rakovinou a pacienti s rakovinou s určitými amplifikacemi eccDNA mají špatnou prognózu. Nadměrná exprese onkogenů, jako jsou MYC a EGFR na eccDNA, pravděpodobně přeprogramuje buňky a indukuje tumorigenní stav.

Anindya Dutta: kruhy v rakovinách jsou delší než kruhy v normálních buňkách a bylo navrženo, že dostanou jiný název: ecdna. Nyní víme, že jsou přítomny téměř ve všech rakovinách, ale nejsou dostatečně velké, aby byly detekovatelné jako dvojité minuty cytogenetikou. Dlouhé ecdna nesou kompletní geny, a když jsou tyto geny onkogeny nebo geny řidiče rakoviny, ecdna umožňují jejich nadměrnou expresi a amplifikaci. Například ecdna nesou následující onkogeny: onkogen MDM2 (původně objevený za dvojitou minutu) inaktivuje tumor supresor p53, zatímco onkogen EGFR způsobuje, že buňky gliomu a glioblastomu hyper-reagují na EGF. Protože ecdna nejsou rovnoměrně odděleny mezi dceřinými buňkami, náhodná distribuce kruhů mezi dceřinými buňkami usnadňuje některým dcerám získat více kopií kruhů a získat tak růstovou výhodu expresí více kódovaného onkogenu. Nemendelovská dědičnost kruhů DNA tedy usnadňuje rakovinné buňce zesílení kruhů, které dávají rakovině růstovou výhodu.

Myslíte si, že eccdna by mohla sloužit jako biomarkery pro hodnocení onemocnění, jakým způsobem a jak?

Dennis Lo: myslím, že molekuly eccDNA v plazmě by byly zajímavým směrem pro výzkum biomarkerů. Jednou z výzev je, že jejich celková koncentrace se zdá být podstatně nižší než koncentrace lineárních molekul DNA v plazmě. Velká distribuce molekul eccDNA v plazmě má jednu výhodu, že delší molekuly by potenciálně přenášely více genetických a epigenetických informací z tkáně původu.

Anindya Dutta: již jsme ukázali, že eccdna jsou 1) uvolňovány do krve z nádorů a z plodu a 2) mohou být detekovány a kvantifikovány v bazénu cirkulující DNA bez buněk. Protože jsou delší (průměr: 250 bází) než cirkulující DNA bez lineárních buněk (průměr: 150 bází) a stabilnější eccdna bez cirkulujících buněk by mohly být užitečné pro detekci mutací v onkogenech (u rakovin) nebo pro detekci mutací ve vývojově důležitých genech(pro neinvazivní prenatální testování). Delší velikost kruhů pozorovaných u rakovin ve vztahu k normální tkáni může být také užitečná jako screeningový nástroj při tekuté biopsii rakovin.

Birgitte Regenberg: Ano, Myslím, že eccDNA může potenciálně sloužit jako biomarker pro řadu nemocí, které jsou spojeny s mutací a genomickým přeskupením. EccDNA z genu receptoru T-buněk se již používá k detekci závažného kombinovaného onemocnění imunodeficience a nedávné údaje ukázaly, že eccDNA z plodu může být detekována v plazmě matky. Zdá se pravděpodobné, že jiná eccDNA v plazmě může sloužit jako markery pro monitorování nádorových onemocnění, i když koncentrace eccDNA v plazmě bude pravděpodobně omezující.

Anton Henssen: v dětské onkologii je ecDNA ve formě dvouminutových chromozomů obsahujících MYCN již zavedeným biomarkerem pro hodnocení klinického rizika u pacientů trpících neuroblastomem. Věřím, že podobně i jiné ecdna by mohly sloužit jako biomarkery pro různé vlastnosti onemocnění u mnoha nádorových entit.

Paul Mischel: ano, existují značné údaje, které naznačují, že ecDNA může být biomarkerem agresivnějších typů rakoviny a může poskytnout nový pohled na schopnost některých rakovin vyvíjet se tak rychle, včetně reakce na terapie. Existují také přesvědčivé důvody k domněnce, že pacienti, jejichž rakoviny jsou poháněny ecDNA, mohou být léčeni jiným způsobem.

jaký je váš oblíbený přístup k analýze eccDNA a jaké jsou výhody?

Birgitte Regenberg: většina eccDNA existuje v malém počtu kopií a není zachycena sekvenováním celého genomu. Pro měření vysoké i nízké kopie eccDNA vyvinula Moje laboratoř metody pro izolaci, sekvenci a sestavení eccDNA (Circle-Seq a Circle-Map, ve spolupráci s L. Marettym, D. Botsteinem A M. Mohiyuddinem). Tyto metody nám umožňují profilovat eccDNA napříč genomy v jakékoli dané buňce a stavu. Můžeme tak získat vhled do toho, jak eccDNA koreluje s věkem a nemocí (spolupráce s J. S. Johansenem a Y. Lou), a na základní úrovni pochopit, jak se tvoří, vyvíjejí a zahynou v populaci buněk.

Anindya Dutta: Moje laboratoř většinou používala zesílení kruhových kruhů rezistentních na exonukleázu s náhodnými hexamery následovanými sekvenováním párových konců (vyhledávač kruhů) k identifikaci spojů, které jsou charakteristické pro kruhy. Protože většina genomických experimentů nezahrnuje zesílení kruhového kruhu, nemůžeme znovu analyzovat genomická data generovaná jinými skupinami k identifikaci kruhů. Nedávno jsme však ukázali, že test pro chromatin přístupný Transposázou pomocí sekvenování (levnější) nebo sekvenování celého genomu (mnohem dražší) může detekovat kruhy DNA. Doufáme, že tyto široce používané techniky umožní identifikaci kruhů v již existujících datových sadách. Kromě toho nedávný článek od Dennise Lo a spolupracovníků ukazuje, že kruhy mohou být detekovány trávením běžnými řeznými restrikčními enzymy a sekvenováním fragmentů pro křižovatky.

Dennis Lo: Nejprve bychom ošetřili plazmatickou DNA exonukleázou, která by odstranila většinu lineárních molekul DNA ve vzorku. Pak bychom rozřízli kruhy pomocí restrikčních enzymů nebo transposázy, abychom vytvořili lineární molekuly DNA pro další analýzu (např. Domníváme se, že metoda založená na transposázách má výhodu v tom, že na rozdíl od přístupu založeného na restrikčních enzymech, který vyžaduje existenci místa rozpoznávání restrikčních enzymů v molekule eccDNA, může metoda transposázy potenciálně působit na jakoukoli molekulu eccDNA.

Pavel Mischel: Můj kolega Vineet Bafna vyvinul výkonnou sadu nástrojů, včetně Amplicon Architect a Amplicon Reconstructor pro analýzu struktury ecDNA. Ve skutečnosti probíhá probíhající práce s Dr. Bafnou a Dr. Verhaakem za účelem lepší analýzy ecDNA ve veřejně dostupných databázích sekvenování celého genomu. Také úzce spolupracujeme s kolegy Dr. Howard Chang a Bing Ren, používáme aspekty“ epigenetické “ sady nástrojů k charakterizaci ecDNA u rakoviny.

Anton Henssen: Rádi specificky izolujeme a sekvenujeme ecDNA s dlouhým čtením sekvenováním, což nabízí příležitost přesně zmapovat strukturu ecDNA.

jaké jsou výzkumné otázky týkající se eccDNA jste nejvíce touží prozkoumat?

Paul Mischel: máme velký zájem pochopit řadu kritických otázek týkajících se ecDNA, které nejsou uvedeny v pořadí podle důležitosti. Za prvé, jak se tvoří ecDNA a jaké jsou klíčové molekulární „hráči“ podílející se na jejím vzniku? Za druhé, jaké jsou molekulární mechanismy podílející se na udržování a funkci ecDNA? Používají se různé komponenty? Používají se stejné komponenty odlišně? Za třetí, jaké jsou klinické důsledky pro pacienty? Může být ecDNA použita k tomu, aby nám řekla něco důležitého o klinickém průběhu? Začtvrté, můžeme najít intervenční body, které lze použít k vývoji nových léčebných postupů, které pomohou pacientům, jejichž rakoviny jsou poháněny ecDNA?

Anton Henssen: jako lékař vědec, jsem nejvíce touží prozkoumat možnosti využít naše chápání o ecDNA najít nové diagnostické a terapeutické přístupy pro pacienty trpící ecDNA řízené rakoviny.

Dennis Lo: Chtěl bych prozkoumat schopnost eccDNA v mateřské plazmě detekovat nebo sledovat poruchy spojené s těhotenstvím (např. Mám také zájem o vývoj novějších a potenciálně komplexnějších přístupů pro analýzu eccDNA. Jsem si vědom, že v současné době dostupné metodiky mohou mít určité zkreslení ve vybraných podmnožinách cirkulujících molekul eccDNA.

Anindya Dutta: chci najít funkce eccdna přítomných v normálních buňkách. Protože jsou tak všudypřítomné a somaticky mozaikové, bude velmi vzrušující, pokud přispějí k mezibuněčné heterogenitě v normálních tkáních nebo přispějí k nějaké formě patologie. Chci také vymezit, jaké cesty se podílejí na tvorbě kruhů v normálních a rakovinných buňkách, v naději, že zasahování do těchto cest u rakovin nám umožní pomoci vyčistit rakoviny potenciálních lokusů genové amplifikace a tím pomoci v terapii. Nakonec chci vidět přijetí sekvenování eccDNA v tekutých biopsiích rakoviny a v neinvazivním prenatálním testování genetických onemocnění plodu.

Birgitte Regenberg: kromě pochopení toho, jak eccDNA může přispět k genetické variabilitě a vývoji eukaryotických genomů, jsem dychtivý pochopit, jak se eccDNA vytváří a udržuje v genomu. Čtyři faktory pravděpodobně určují obrat kruhové DNA v buněčné linii: rychlost, kterou je tvořen z jeho chromozomálního lokusu, jeho schopnost replikovat, jeho způsob segregace, stejně jako růstová výhoda nebo nevýhoda, kterou poskytuje hostitelské buňce. Kromě toho mohou eukaryotické buňky potenciálně mít mechanismy pro degradaci nebo vylučování eccDNA. To je zvláště důležité pro meiotické buňky v mnohobuněčných organismech, protože eccDNA v zárodečné linii může mít v příští generaci velké negativní účinky. Nedávné údaje z kvasinek naznačují, že meiotické buňky skutečně vyvinuly mechanismy pro sekvestraci podmnožiny eccDNA (z Ünalovy laboratoře v Berkley) a zdá se pravděpodobné, že to samé bude platit pro zárodečné buňky v mnohobuněčných organismech, jako jsou lidé.

autorské příspěvky

všichni autoři potvrdili, že přispěli k intelektuálnímu obsahu tohoto příspěvku a splnili následující 4 požadavky: (a) významné příspěvky k koncepci a návrhu, získávání dat nebo analýze a interpretaci dat; (b) vypracování nebo revize článku pro duševní obsah; (c) konečné schválení publikovaného článku; a (d) dohoda o odpovědnosti za všechny aspekty článku, čímž se zajistí, že otázky týkající se přesnosti nebo integrity jakékoli části článku budou náležitě prozkoumány a vyřešeny.

zveřejnění autorů nebo potenciální střet zájmů

po odeslání rukopisu vyplnili všichni autoři formulář pro zveřejnění autora. Zveřejnění a / nebo potenciální střet zájmů:

zaměstnání nebo vedení

R. W. K. Chiu, Klinická chemie, AACC; Y. M. D. Lo, Klinická chemie, AACC, Dra Limited, Take2 Holdings.

poradce nebo poradní Role

R. W. K. Chiu, Grail; Y. M. D. Lo, Grail, Decheng Capital; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

vlastnictví akcií

R. W. K. Chiu, Grail, Dra Limited, Take2 Holdings; Y. M. D. Lo, Grail, Dra Limited, Take2 Holdings; P. Mischel, Boundless Bio, Inc.

Honoraria

žádné deklarováno.

financování výzkumu

R. W. K. Chiu, Grail; a. Dutta, National Institutes of Health; Y. M. D. Lo, grál, Hong Kong Research Grants Council tematické výzkumné schéma T12-403/15N a T12-401 / 16W.

odborné svědectví

žádné deklarováno.

patenty

R. W. K. Chiu, PCT / CN2020 / 081066; a. Dutta, USA PPA 62832443; Y. M. D. Lo, Vícenásobné patenty a patentové přihlášky v diagnostických aplikacích DNA bez buněk; p. Mischel, SD-2019-149-1, SD-2019-149-2, SD-2019-149-3.

Ostatní odměny

a. Dutta, Gordon Research Conference, Cold Spring Harbor Lab, BIH Academy, Shenzhen Medical School.

nestandardní zkratky

• eccDNA

  extrachromozomální kruhová DNA

• ecDNA

  extrachromozomální DNA

• mtDNA

  mitochondriální DNA