CI-MS je hmotnostní spektroskopická technika, při které analyt reaguje s ionty reakčního plynu.
v běžné elektronové ionizační hmotnostní spektrometrii, EI-MS, je analyt bombardován energetickými elektrony za vzniku iontů. Energetické ionty se rozkládají na mnoho fragmentačních produktů.
v hmotnostní spektrometrii chemické ionizace je analyt ve velkém přebytku reakčního plynu, jako je metan, amoniak nebo isobutan.
elektronový paprsek přednostně ionizuje reakční plyn. Srážky s jinými molekulami reagenčního plynu vytvářejí ionizační plazmu.
plazma pak reaguje s analytem za vzniku kladných a záporných iontů.
CI je proces s nižší energií než EI. Často přináší menší fragmentaci a jednodušší spektrum. Spektrum CI má obvykle snadno identifikovatelný molekulární iont.
při analýze hmotnostních spekter nejprve identifikujete molekulární ionty. Pak je poměrně snadné identifikovat fragmenty.
u EI nemusí existovat žádné molekulární ionty nebo mohou být příliš slabé na potvrzení.
naproti tomu CI je měkčí ionizační metoda než EI. Fragmentace je méně pravděpodobná, takže molekulární ionty jsou výraznější.
například cukry mohou být těkavější přeměnou jejich OH skupin na trimethylsilylové (TMS) ethery.
ROH + (CH₃ )SSICL → RO-Si (CH₃)
sacharóza má 8 OH skupin.
tvoří ether okta-TMS s molekulárním vzorcem C₃₆h₈₆osisi₈.
spektrum EI nevykazuje žádný detekovatelný molekulární iont.
naproti tomu spektrum CI s amoniakem jako reakčním plynem vykazuje prominentní molekulární iont (M+NH₄)⁺.