excitační synaptický přenos může být zprostředkován změnou citlivosti receptorů AMPA. Jednou běžnou metodou změny citlivosti je změna počtu AMPA receptorů v postsynaptické membráně prostřednictvím endocytózy. Různé podněty, včetně CNQX, mají různé účinky na internalizaci AMPA receptoru. CNQX, o kterém je známo, že je kompetitivním antagonistou receptoru AMPA/kainátu, se používá ve studiích zkoumajících, zda je endocytóza receptoru AMPA závislá na ligandu. V kultuře hipokampálních neuronů CNQX částečně inhiboval internalizaci AMPA receptoru, která byla stimulována AMPA. Nicméně, když byly hipokampální neurony léčeny samotným CNQX, internalizace AMPA receptoru stále probíhala jak v soma, tak v dendritech. APV (antagonista receptoru NMDA) nebo nimodipin (blokátor kalciového kanálu s napětím) také nebyli schopni blokovat tuto internalizaci, což naznačuje, že aktivace receptoru není podmínkou pro endocytózu receptoru AMPA. Typ receptorů AMPA endocytovaných v důsledku stimulace CNQX lze také identifikovat pomocí CNQX. V buňkách HEK označených podjednotkami GluR stimuluje CNQX internalizaci receptorů GluR1 a GluR2. Intracelulární oblast konzervovaná v GluR1 i GluR2 na ocasu Glur2 C-terminálu byla identifikována a odstraněna. Delece tohoto segmentu vedla ke snížení konstitutivní endocytózy receptoru GluR2 v buňkách HEK, což určilo sekvenci určující tento účinek.
je známo, že CNQX je selektivním kompetitivním antagonistou jak pro AMPA receptory, které mají hodnotu IC50 400 nM, tak pro kainátové receptory, které mají hodnotu IC50 4 µM. Také nekonkurenčně inhibuje NMDA receptory. CNQX se tak používá k izolaci spontánních inhibičních postsynaptických proudů zprostředkovaných GABAA receptorem. Účinky CNQX na frekvenci spontánních inhibičních postsynaptických proudů jsou nezávislé na jejich působení na ionotropní glutamátové receptory. Ačkoli hodnota EC50 CNQX na frekvenci spontánních inhibičních postsynaptických proudů je podobná hodnotě IC50 na kainátových receptorech, blokáda kainátových receptorů není zodpovědná za působení CNQX. NBQX je derivát chinoxalinu, o kterém je známo, že je účinnější než CNQX při blokování kainátových receptorů, ale nedošlo k velkému zvýšení frekvence spontánních inhibičních postsynaptických proudů. Účinky CNQX navíc nebyly replikovány kynurenátem (antagonistou glutamátového receptoru) nebo NS-102 (selektivním blokátorem kainátového receptoru), protože nedošlo ke zvýšení frekvence spontánních inhibičních postsynaptických proudů. Kromě toho D-AP5 a 7-CIK neovlivnily frekvenci spontánních inhibičních postsynaptických proudů, což dokazuje, že působení NMDA receptorů nezohledňuje účinky CNQX.