chronická eozinofilní leukémie spojená s PDGFRA je způsobena mutacemi v genu PDGFRA. Tento stav se obvykle vyskytuje v důsledku genetických přeskupení, které fúzují část genu PDGFRA s částí jiného genu. Zřídka se u lidí s tímto stavem vyskytují změny jednotlivých stavebních bloků DNA (bodové mutace) v genu PDGFRA. Genetické přeskupení a bodové mutace ovlivňující Gen PDGFRA jsou somatické mutace, což jsou mutace získané během života člověka, které jsou přítomny pouze v určitých buňkách. Somatická mutace se vyskytuje zpočátku v jedné buňce, která pokračuje v růstu a dělení a produkuje skupinu buněk se stejnou mutací (klonální populace).
nejčastější genetická abnormalita v chronické eozinofilní leukémii spojené s PDGFRA je výsledkem delece genetického materiálu z chromozomu 4, který spojuje část genu PDGFRA a část genu FIP1L1 a vytváří fúzní Gen FIP1L1-PDGFRA.
Gen FIP1L1 poskytuje pokyny pro protein, který hraje roli při vytváření genetických plánů pro výrobu proteinů (messengerová RNA nebo mRNA).
Gen PDGFRA poskytuje pokyny pro výrobu receptorového proteinu, který se nachází v buněčné membráně určitých typů buněk. Receptorové proteiny mají specifická místa, do kterých některé další proteiny, nazývané ligandy, zapadají jako klíče do zámků. Když se ligand váže (váže), protein receptoru PDGFRA se zapne (aktivuje), což vede k aktivaci řady proteinů ve více signálních drahách. Tyto signální dráhy řídí mnoho důležitých buněčných procesů, jako je růst a dělení buněk (proliferace) a přežití buněk.
fúzní Gen FIP1L1-PDGFRA (stejně jako další fúzní geny PDGFRA) poskytuje pokyny pro výrobu fúzního proteinu, který má funkci normálního proteinu PDGFRA. Fúzní protein však nevyžaduje aktivaci vazby ligandu. Podobně bodové mutace v genu PDGFRA mohou vést k proteinu PDGFRA, který je aktivován bez vazby ligandu. V důsledku toho jsou signální dráhy neustále zapnuty (konstitutivně aktivovány), což zvyšuje proliferaci a přežití buněk. Pokud se mutace fúzního genu FIP1L1-PDGFRA nebo bodové mutace v genu PDGFRA vyskytují v prekurzorech krevních buněk, je růst eozinofilů (a příležitostně i dalších krevních buněk, jako jsou neutrofily a žírné buňky) špatně kontrolován, což vede k chronické eozinofilní leukémii spojené s PDGFRA. Není jasné, proč jsou eozinofily přednostně ovlivněny touto genetickou změnou.