prostorové polohování je základním principem upravujícím jaderné procesy. Chromatin je organizován jako hierarchie od nukleosomů po Mbp chromatinové domény (CD) nebo topologicky asociující domény (TADs) k kompartmentům vyšší úrovně kulminujícím v chromozomových teritoriích (CT). Mikroskopické a sekvenační techniky doložily organizaci chromatinu jako kritický faktor regulující genovou expresi. Například, zesilovače se vracejí zpět k interakci se svými cílovými geny téměř výhradně v TADs, distálně lokalizované koregulované geny se po aktivaci přemístily do běžných transkripčních továren, a Mbp CD vykazují dynamické pohybové a konfigurační změny in vivo. Dlouhodobou otázkou v jádrovém poli je, zda interaktivní jaderná matice poskytuje přímé spojení mezi strukturou a funkcí. Nálezy nerandomického radiálního umístění CT v jádru naznačují možnost preferenčních interakčních vzorů mezi populacemi CT. Sekvenční značení až 10 CT následované aplikací počítačového zobrazování a algoritmů pro těžbu geometrických grafů odhalilo interchromozomální sítě specifické pro buněčný typ (ICN) CT, které se mění během buněčného cyklu, diferenciace a progrese rakoviny. Navrhuje se, aby ICN korelovala s globální úrovní regulace genomu. Tyto přístupy také prokázaly, že velkoplošná 3-D topologie CT je specifická pro každé CT. Specifická blízkost určitých chromozomálních oblastí v normálních buňkách může vysvětlit sklon odlišných translokací v podtypech rakoviny. Pochopení toho, jak jsou geny dysregulovány při narušení normálního „zapojení“ jádra translokacemi, delece, a amplifikace, které jsou charakteristickými znaky rakoviny, by měla umožnit cílenější terapeutické strategie.