A Microbial Biorealm page on the genus Chlamydophila pneumoniae
Classification
Higher order taxa
Kingdom: Bacteria; Phylum: Chlamydiae; Order: Chlamydiales; Genus: Chlamydophila; Species: C. pneumoniae;
Species
NCBI: Taxonomie
Chlamydophila pneumoniae
popis a význam
Chlamydophila pneumoniae je druh tyčinkovitých gramnegativních bakterií, o nichž je známo, že jsou hlavní příčinou pneumonie, astmatu, bronchitidy, respirační infekce, ischemické choroby srdeční a aterosklerózy u lidí. Je to bakterie ve vzduchu a asi 50% dospělých ve Spojených státech má důkazy o předchozí infekci ve věku 20 let. Podobně jako viry je Chlamydophila pneumoniae parazitický organismus, který se nemůže množit mimo hostitelskou buňku, a je proto závislý na zdraví hostitelské buňky pro přežití.
než byly vynalezeny pokročilejší výzkumné nástroje, které porovnávaly DNA a antigenní materiál, existoval pouze jeden rod pod čeledí Chlamydiaceae. Tento rod byl chlamydie. Po nalezení velmi odlišného DNA a antigenního materiálu byl však do čeledi zaveden další Rod: Chlamydophila, což znamená „Clamydia-like“. Dříve pojmenovaný Chlamydia pneumoniae byl tedy přejmenován na Chlamydophila pneumoniae .
struktura genomu
genová sekvence Chlamydophila pneumoniae CWL029, kmene nejběžnějšího ve Spojených státech, byla plně sekvenována, stejně jako u mnoha jiných kmenů, v roce 1999. Genom obsahuje 1 230 230 párů bází kruhové DNA. Existuje 1 052 proteinových genů a 43 RNA genů. U tohoto druhu dosud nebyly identifikovány žádné plazmidy .
buněčná struktura a metabolismus
Chlamydophila pneumoniae existuje ve stacionárním, neinfekčním stavu mezi hostiteli známými jako elementární tělo (EB). Ačkoli elementární tělo není infekční, má schopnost odolávat environmentálním stresům, dokud nedosáhne nového hostitele, kde se přemění na retikulární tělo (RB). Bakterie podléhají aerobnímu dýchání. Chlamydophila pneumoniae má inkubační dobu od 7 do 21 dnů v rámci svého hostitele a dělí se každé 2-3 hodiny .
ekologie
Chlamydophila pneumoniae je známá a je pozorována u lidských hostitelů po celém světě. Mnoho studií bylo provedeno ve Spojených státech a Japonsku. Bylo prokázáno, že tyto dva izolované kmeny Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae J138 (Japonsko)a Chlamydophila pneumoniae CWL029 (USA) jsou si navzájem velmi podobné v celkové funkci, pouze s rozdílem asi 3 600 párů bází. Míra infekce mezi pohlavími byla stejná a neexistuje žádná zaujatost vůči jednomu nebo druhému pohlaví.
patologie
elementární forma bakterií je přenášena malými kapičkami vody do plic jiného hostitele, kde je fagtocytována do buněk. Jakmile je elementární tělo přijato, transformuje se do retikulovaného těla, kde se replikuje v buňce. S četnými kopiemi sebe sama v buňce se retikulované tělo vrátí zpět do své Elementární formy, lyzuje buňku a znovu začíná cyklus infekce. Jako mezofil je optimální teplota replikace těchto bakterií 37 stupňů Celsia.
Chlamydophila pneumoniae je také známo, že infikuje plazy, jako jsou hadi, leguáni, žáby, želvy a savci, jako jsou koaly.
mezi příznaky patří suchý kašel, únava, bolest na straně hrudníku, horečka, ztráta chuti k jídlu a bolesti.
aplikace na biotechnologie
ačkoli není známo, že by Chlamydophila pneumoniae přímo produkovala žádné užitečné enzymy nebo sloučeniny, kvůli své rozšířené infekci po celém světě byla antibiotika proti této bakterii produkována nepřímo. Tato antibiotika se však ukázala jako užitečná pouze ve velmi raných stádiích infekce. Tři typy antibiotik, které se běžně používají, jsou azithromycin, doxycyklin a klarithromycin.
současný výzkum
existují dvě pozorování, u nichž je známo, že roztroušená skleróza (MS)způsobuje onemocnění. První pozorování náhlá smrt oligodendritů degradací myelinového pláště. Dalším pozorováním je, že mnoho bakterií, včetně Chlamydophila pneumoniae, byly úzce spojeny s MS. Mechanismus Chlamydophila pneumoniae v lidském těle je diskutován .
existuje hypotéza, že symptomatologie karotického onemocnění úzce souvisí s přítomností Chlamydophila pneumoniae. Karotidové onemocnění bylo testováno spolu s přítomností Chlamydophila pneumoniae, aby se zjistilo, zda jsou ve vzájemné korelaci. Ukazuje se, že cerebrovaskulární onemocnění je silně spojeno nejen s přítomností Chlamydophila pneumoniae a faktorem nazývaným faktor TNF-alfa .
bylo všeobecně přijímáno, že přítomnost Chlamydophila pneumoniae v mozkomíšním moku (CSF) velmi úzce souvisí s roztroušenou sklerózou (MS). Aby bylo možné tuto myšlenku otestovat a vyčítat, vědci provedli kontroly PCR a metody extrakce DNA u osob s roztroušenou sklerózou. Po těchto kontrolách bylo skutečně prokázáno, že vysoká koncentrace Chlamydophila pneumoniae v mozkomíšním moku je spojena s RS .
1. Shirai, m., Hirakawa, h., Kimoto, m., Tabuchi, m., Kishi, F., Ouchi, k., Shiba, T., Išii, k., Hattori, m., Kuhara, s. a Nakazawa, T. „Porovnání celých genomových sekvencí Chlamydia pneumoniae J138 z Japonska a CWL029 z USA.“Nukleové Kyseliny Res. (2000) 28:2311-2314.
2. Everett, K. D., Bush, R. M., Andersen, a. a. „Emended description of the order Chlamydiales, parachlamydiaceae fam. Novum. a Simkaniaceae fam. Novum., každý obsahující jeden monotypický rod, revidovaná taxonomie čeledi Chlamydiaceae, včetně nového rodu a pěti nových druhů, a standardy pro identifikaci organismů.“Int. J. Syst. Bakteriol. (1999) 49:415-440..
3. Cunningham, A. F., Johnston, S. L., Julious, S. A., Lampe, F. C. Ward, M. E. chronická infekce Chlamydia pneumoniae a exacerbace astmatu u dětí. European Respiratory Journal. (1998) 11:345 – 349.
4. Fukushi, h., a Hirai, k. “ polymorfismy délky restrikčních fragmentů rRNA jako genetické markery k diferenciaci Chlamydia spp.“Int. J. Syst. Bakteriol. (1993) 43:613-617.
5. Gaydos, Ca, Palmer, L., Quinn, T. C., Falkow, s. a Eiden, J. J. “ fylogenetický vztah Chlamydia pneumoniae k Chlamydia psittaci a Chlamydia trachomatis stanovený analýzou 16S ribozomálních sekvencí DNA.“Int. J. Syst. Bakteriol. (1993) 43:610-612.
6. Grayston, J T., Kuo, C. C., Campbell, L. A. & Wang, S. P. Chlamydia pneumoniae sp-nov pro Chlamydia Sp kmen TWAR. Mezinárodní žurnál systematické Bakteriologie (1989) 39: 88-90.
7. Stratton CW, Wheldon DB. Roztroušená skleróza: infekční syndrom zahrnující Chlamydophila pneumoniae.. Trendy Mikrobiol. (2006) 14(11):474-9.
8. Stratton CW, Sriram s. asociace Chlamydia pneumoniae s onemocněním centrálního nervového systému.. Mikrobi Infikují. (2003) 5(13):1249-1253.
9. Sriram S, Yao s, Mitchell WM, Calibresi P, Stratton CW, Ikejima H, Yamamoto y. srovnávací studie přítomnosti Chlamydia pneumoniae v mozkomíšním moku z klinicky definitivních a monosympatických patinetů sklerózy muliple. Klinická a diagnostická laboratorní imunologie) 2003) 9: 1332-1337.