hlavní odpovědnost za záležitosti životního prostředí nese oddělení environmentálních programů na Ministerstvu zdravotnictví a v Národním plánovacím úřadu, jakož i v ekologickém poradním úřadu na Ministerstvu Národního blahobytu a ministerstvu životního prostředí na Ministerstvu zahraničních věcí.
hlavními environmentálními problémy Chile jsou odlesňování a výsledná eroze půdy a znečištění ovzduší, vody a půdy. Znečištění ovzduší z průmyslu a dopravy a znečištění vody jsou zvláště akutní v městských centrech, kde se počet obyvatel za posledních 30 let zdvojnásobil. V roce 1996 dosáhly průmyslové emise oxidu uhličitého v Chile 48,7 milionu metrických tun. Neupravená Odpadní voda představuje hlavní hrozbu pro kvalitu vody v zemi. K roku 2001 mělo Chile 928 cu km obnovitelných vodních zdrojů. Zatímco 99% obyvatel měst má čistou pitnou vodu, pouze 58% obyvatel venkova má stejný přístup.
mezi ohrožené druhy v Chile patří Jižní Andský huemul, tundra stěhovavý Sokol, puna rhea, Chilský woodstar, Husa rudohlavá a zelená mořská želva. K roku 2001 bylo za ohrožené považováno 16 druhů savců z celkem 91. Z 296 chovných druhů ptáků bylo 18 ohroženo vyhynutím. Ohroženy byly také čtyři druhy sladkovodních ryb a 268 druhů rostlin.