Charles Chauncy byl pravnukem Charlese Chauncyho, druhého prezidenta Harvard College. Mladý Charles se narodil a vzdělával v Bostonu. V roce 1721 absolvoval Harvard a v roce 1724 zde získal magisterský titul. Vysvěcen jako ministr prvního kostela v Bostonu v roce 1727, působil v této prestižní pozici 60 let. V roce 1727 se oženil s první ze tří manželek Elizabeth First, v roce 1738 se oženil s Elizabeth Townsendovou a v roce 1760 s Mary Stoddardovou. Byl to vážný, pilný člověk a energický učenec náboženství a Bible.
Chauncy se stal největším kritikem velkého probuzení. V roce 1741 přednesl přednášku pozoruhodně blízkou myšlení nového anglického duchovního Jonathana Edwardse, ale o rok později Chauncy kázal proti oživení. Jeho sezónní myšlenky na stav náboženství (1743) jsou pečlivě vystavěným pojednáním proti náboženskému nadšení. S velkým odkazem na Bibli představil velké probuzení jako čas uprchlého emocionalismu, duchovní pýchy, klamu a nepořádku. Když se George Whitefield, velký anglický evangelista, vrátil do Nové Anglie v roce 1744, nebyl vítán ani na Harvardu, ani na Yale, a Chauncy, člen Harvardské Rady dozorců, si vybral tento okamžik, aby kázal exkoriaci Whitefielda a probuzení.
ačkoli se Chauncy považoval za Kalvinistu, reinterpretoval kalvinismus v několika hlavních bodech a odklonil se od názorů jeho ortodoxnějších současníků. Kázal proti Anglikánskému zřízení v koloniích. Chauncy viděl rozum jako podstatu „naší postavy jako mužů“ a věřil, že to pomůže vést člověka ke spáse. Kontrast mezi vírou a skutky jako protiklady, cítil, byl příliš zdůrazněn.
chuncyho víra v základní spolehlivost zdravého rozumu, dokonce i v nedobytné, byla odvozena z jeho důvěry v benevolenci božstva. Domníval se, že Kristova smrt je nezbytná pro spásu člověka, nikoli pro uklidnění pomstychtivého Boha, ale proto, že tato kataklyzmatická událost probudila hříšníky k Boží autoritě. Chauncy cítil, že Kristus nezemřel, aby vykoupil několik vyvolených, ale aby zachránil celé lidstvo, a že původní hřích nebyl imputovaným stavem, ale pouze vrozenou tendencí. Postupoval postupně směrem k univerzalismu a pojetí Boha jako jediného monarchy vesmíru spíše než tříčlenného Boha kalvinismu. Tato témata jsou základem jeho vlivného Compleat pohledu na biskupství (1771), stejně jako dvě další díla, Benevolence božstva (1784) a tajemství ukryté před věky … nebo spása všech lidí … (1784), obě publikovány anonymně v Londýně, ale zřejmě psány před rokem 1768. Chauncyho myšlení významně předznamenalo vývoj 19. století v teologii Nové Anglie.