detekce dvojitých rekombinantních tříd ukazuje, že musí dojít k dvojitým crossoverům.Když to víme, můžeme se zeptat, jsou crossovery v sousedních oblastech chromozomů nezávislé nebo doesa crossover v jedné oblasti ovlivňuje pravděpodobnost, že dojde k crossoveru v sousednímregionu. Ukazuje se, že často nejsou nezávislé: interakce se nazývá rušení.
k analýze lze přistupovat následujícím způsobem. Pokud jsou přechody ve dvou regionechnezávislé, pak podle pravidla produktu (viz strana 37) by se frekvence dvojitých kombinantů rovnala součinu rekombinantních frekvencí v sousedních oblastech. V rekombinačních datech v-ct-cv je hodnota RF vv-ct 0,132 a hodnota 0,064, takže lze očekávat dvojitékombinanty na frekvenci0. 132 × ct-cv0. 064 = 0,0084 (0,84 procenta), pokud existujenezávislost. Ve vzorku 1448 mušek se očekává 0, 0084 × 1448 = 12 dvojitých rekombinantů.Data však ukazují, že ve skutečnosti bylo pozorováno pouze 8. Pokud by tento nedostatek dvojitých rekombinantbyly důsledně pozorovány, ukázalo by nám, že tyto dvě oblasti nejsou nezávislé anaznačují, že distribuce crossoverů upřednostňuje singly na úkor čtyřhry. Jinými slovy, existuje nějaký druh rušení: crossover snižuje pravděpodobnostkřížení v přilehlé oblasti.
Interference se kvantifikuje nejprve výpočtem termínu zvaného koeficient koincidence (c. o. c.), což je poměr pozorovaných k očekávaným dvojitým rekombinantům odebraným od 1. Proto
Interference (I) = 1-c. o. c. =
v našem příkladu
v některých oblastech nejsou nikdy pozorovány dvojité rekombinanty. V těchto případech c. o. c. = 0, takže I = 1 a rušení je dokončeno. Většinou jsou hodnoty interference, které jsoupřipojené k mapování lokusů chromozomů, jsou mezi 0 a 1; ale v určitých zvláštních situacích pozorované zdvojnásobení překračují očekávané hodnoty, což dává negativní hodnoty interference.
rekombinační analýza se tak silně opírá o tříbodové testy a rozšířené verzeje, že stojí za to provést podrobné shrnutí analýzy, které končí interferencemvýpočet. Použijeme číselné hodnoty z dat na lokusech v, ct a cv.
Vypočítejte rekombinantní frekvence pro každý pár genů:
reprezentují vazebné vztahy v mapě vazeb:
Určete dvojité rekombinantní třídy.
Vypočítejte frekvenci a počet očekávaných dvojitých rekombinantů, pokud nedochází k interferenci:
vypočítat rušení:
možná jste se divili, proč vždy používáme heterozygotní ženy pro testcrosses v našich příkladech vazby v Drosophile. Kdypr VG/pr+ VG+muži jsou zkříženi spr vg / pr vg ženy, pouzepr vg / pr+ vg + a PR vg/pr vg progenyjsou obnoveny. Tento výsledek ukazuje, že v Drosophilamales nedochází k přechodu. Tato absence přechodu u jednoho pohlaví je však omezena na určité druhy; není tomu tak u mužů všech druhů (nebo u heterogametického pohlaví). V jiných organismech dochází k přechodu u mužů XY a u žen WZ. Důvodem nepřítomnostikřížení u mužů Drosophila je to, že mají neobvyklou profázi I, bez synaptonemálních komplexů.
mimochodem, existuje také rekombinační rozdíl mezi lidskými pohlavími. Ženy vykazují vyšší rekombinantní frekvence pro stejné lokusy než muži.