„v předchozí studii jsme navrhli, že duplikace i delece malého kousku chromozomu 17 a také jednotlivé mutace se vyskytly ve stejné události,“ uvedla spoluautorka Dr. Claudia m.B. Carvalho odborná asistentka molekulární a lidské genetiky na Baylor College of Medicine. „Zde jsme použili řadu technologií s vysokým rozlišením a výkonné statistické analýzy k potvrzení a rozšíření našich předchozích pozorování. Abychom toho dosáhli, podívali jsme se blíže na genetické změny v tomto malém kousku chromozomu 17 ve Velké kohortě nesouvisejících pacientů s Potocki-Lupski nebo Smith-Magenisovým syndromem.“
“ zjistili jsme, že kohorta může být rozdělena do dvou skupin. Jedna skupina zahrnuje jedince, kteří mají společné stejné změny ve stejné oblasti DNA. Říkáme jim opakující se změny, protože pozorujeme opakující se delece nebo duplikace stejných segmentů DNA, “ řekla spoluautorka Dr. Christine R. Beck, bývalý postdoktorand v Bayloru, který je v současné době odborným asistentem na Katedře genetiky a genomových věd na University of Connecticut Health Center a Jackson Laboratory for Genomic Medicine.
ve druhé skupině to vědci nazývají neopakující se, každý z pacientů měl jiný vzorec změn DNA.
„vzorec variací v rámci non-rekurentní skupiny je složitější než u rekurentní skupiny,“ řekl Beck. „Navrhujeme, aby k opakujícím se a opakujícím se přestavbám docházelo různými mechanismy.“
vědci dále porovnávali opakující se a neopakující se vzorky týkající se počtu mutací DNA s jednou bází. Jako odkaz také porovnali vzorky pacientů s vzorky příslušných rodičů a se vzorky od jednotlivců bez podmínek.
„v recidivující skupině jsme viděli pouze čtyři z 19 pacientů s mutacemi v těchto oblastech, zatímco 13 z 26 pacientů v recidivující skupině mělo mutace a vyskytly se rychlostí, která byla 5 až 50krát vyšší,“ řekl Carvalho. „Většina z těchto mutací se vyskytla v genech. To je důležité, protože tyto typy mutací mohou přispět k onemocnění.“
“ naše statistické analýzy ukázaly, že mutace byly u pacientů zcela nové-rodiče je nenosí. Mutace se také vyskytují spolu s duplikacemi nebo delecemi na stejném chromozomu 17 a mohou se vyskytovat po dlouhém úseku této oblasti, “ řekl spoluautor Dr. Zeynep Coban-Akdemir, počítačový vědec a genetika a genomika postdoktorand molekulární a lidské genetiky v Baylor.
„dále,“ řekl spoluautor Xiaofei Song, postgraduální student molekulární a lidské genetiky v Bayloru, “ naše analýzy zjistily, že velké množství mutací se vyskytuje kolem bodů zlomu, míst na DNA, kde dochází k delecím nebo duplikacím,a že mutace mají tendenci být blízko sebe.“
tato studie otevřela okno do složitosti genetických změn v této malé oblasti chromozomu 17, které vedou k těmto dvěma vzácným stavům, a naznačuje, že jiné podmínky, které zahrnují duplikace nebo delece segmentů chromozomů, mohou vzniknout podobnými mechanismy.
„čtyři vědkyně, Claudia, Zeynep, Xiaofei a Christine, ze všech koutů světa (Brazílie, Turecko, Čína a USA), vytrhly úžasný kus vědy a naučily nás všechny hodně na cestě,“ řekl spoluautor Dr. James R. Lupski, Cullen profesor molekulární a lidské genetiky v Baylor, hlavní řešitel v Baylor Hopkins Center for Mendelian Genomics a fakulty s Baylor genetics a genomics graduate training program.